我大学本科读的是数学专业，研究生想考读理论物理困难吗？

我是物理专业的，感觉不是太困难。但是还是有些不同，我们物理要求的数学是比较实用的，没有你们那么严谨。还有一些基本的课程多少，可能你需要补习一下。现在做百项创新，觉得基础知识虽然重要，但思维方法也重要，有些问题搞不懂没关系，很多都是现用现学的。你的数学功底如果扎实，如果真的有乐趣，那肯定没问题

我想去研究量子力学，目前中国哪所大学量子力学系比较

没有量子力学系，量子力学是基础学科，如果你要专门研究更前沿的量子力学理论有关的问题，应该是理论物理专业，如果是研究实验有关的问题，高能物理涉及的应该比较多。因为目前任何物理方面的前沿课题多少和量子力学有关，只要你研究前沿问题就行，但是如果你所谓的研究量子力学是研究最根本的部分，那你最好确定自己能有比肩爱因斯坦的头脑，否则就算了。

数学分析和高等数学有什么区别?

数学分析是数学专业的基础专业课，但有的学校和其他专业也有学数学在分析的。数学分析是将高等数学中的一些定理的来龙去脉讲的很清楚，比高等数学讲的要深，而且讲的广，主要侧重理论。而高等数学主要侧重于计算，主要是微积分。
如果楼主想要搞理论物理的话，我还是推荐您去学习数学分析，数学分析可以让你锻炼你的思维，由于我是数学专业的，所以我推荐两本教材，一本是由华东师范大学数学系编的，由高等教育出版社出版的《数学分析》，还有一本是复旦大学出的《数学分析》，希望对楼主有帮助。